تجري هذه العملية بعد إجراء الحقن المجهري و بعد أن تصل البويضة الملقحة إلى اليوم الثالث ( وهي 6-8 خلايا ) يتم سحب خلية واحدة فقط عن طريق ثقب جدار الجنين دون إلحاق أي ضرر به أو أخذ العينة من الجنين في اليوم الخامس و تجميد الأجنة ومن ثم تتم دراسة الخلية بطريقة صبغ الكروموسومات لمعرفة جنس الجنين و خلل الكروموسومات.

في المرحلة الاخيرة يتم استبعاد الأجنة المصابة بخلل الكروموسومات مثل المغولي و ما شابه والأجنة ذات الجنس الغير مطلوب، وتعاد الأجنة بالجنس المطلوب الخالية من أي خلل في الكروموسومات إلى الرحم، ومن ثم تقوم المرأة باستخدام المثبتات والانتظار لمدة أسبوعين للتأكد من حدوث الحمل. يمكن إجراء فحص الكرموسومات للأجنة لمن لديها فشل انغراس متكرر أو إجهاض متكرر.